臭氧的氧化性使之具有較強的滅菌效果，但事物總是兩面的，強氧化性又會對易于氧化的物品有破壞，如對橡膠的氧化就非常嚴重。而有些藥粉含有易氧化的成分，如蒽醌類、熊果酸等，如果濃度太高就會對他們破壞嚴重;但因為藥粉的微生物含量一般都比較高，原生藥材直接入藥的藥粉微生物甚至達到幾百萬每克，如此高的微生物含量用一般的臭氧濃度是奈何不了的，所以既能有效滅菌又不嚴重破壞有效成分，就必然對臭氧濃度的選用提到了很高的精度。

  3、恰當?shù)臅r間

  臭氧滅菌是一個化學過程，它需要一定的反應時間，理論上講在濃度適當?shù)那疤嵯拢娱L滅菌時間有助于提高臭氧的滅菌效率;但臭氧滅菌的同時也是和易氧化成分發(fā)生氧化反應的過程，臭氧和藥粉的接觸時間越短，對藥粉的化學成分破壞越小，這就對滅菌時間控制提出了較高的要求。只有結合適當?shù)臐舛龋涍^多次的實驗才能合理確定滅菌的時間，否則會對藥粉的化學成分有較大的破壞，在我們的針對性實驗中曾發(fā)現(xiàn)臭氧對白術中目標成分熊果酸的破壞率高達68%。

  4、較高的純度

  由于臭氧制備技術和氣源處理技術原因，傳統(tǒng)的臭氧發(fā)生器會產生大量有毒的氮氧化物(NOx)，氮氧化物會和藥粉中的某些化學成分反應，形成亞硝酸鹽、硝酸鹽等有害物質。所以用于藥粉滅菌的臭氧發(fā)生器及氣源要嚴肅對待，否則會產生不良后果。